vai nella cartella config\console e troverai la cartella FUSION che configura il Megadrive, bene copiala e rinominala in MasterSystem. Fatto ciò rinomina anche i 2 files txt che trovi all'interno Fusion.ini e Fusion-0.ini in MasterSystem.ini e MasterSystem-0.ini (cartella e file .txt devono avere lo stesso nome).
Nel MasterSystem.ini cambia il nome del Sistema emulato da Megadrive a Master System, cambia i 2 fusion-0.ini in MasterSystem-0.ini, cambia il nome del Layout (se hai creato un layout appropriato devi assegnargli il nome con il quale è stato chiamato ad Esempio:- MASTERSYSTEM (localizzato nella cartella Layout).
Nella stringa emulatori visto che entrambi utilizzano il KEGA (come il GameGear...) basta aggiungere -sms prima della stringa relativa al percorso roms/estensione.
Cambiare i vari percorsi relativi alla localizzazione delle ROMS, SNAP,COVER etc etc (sia gli emulatori che le roms con relative immagini possono essere localizzate in qualsiasi hd o partizione anche differenti fra loro!) e salvare il tutto.
Al riavvio FEEL vedrà automaticamente il nuovo sistema inserito e potrai caricare in Optiom/Build list la lista dei giochi del nuovo sistema inserito.
Ora una premessa... scrivo questo da lavoro quindi non ho sottomano feel x una verifica ma a memoria nomi e percorsi devono essere corretti!
Spero di essere stato esaustivo, di più non saprei come aiutarti

Fammi sapere
Ciao